Льготы по НДС и налогу на прибыль для медклиники в простом товариществе: разъяснение Минфина и настройки в 1С

Что изменилось для медклиник в простом товариществе после письма Минфина

Письмо Минфина от 30.07.2026 № 03-07-07/66335 содержит три вывода, от которых зависит налоговый учет медклиники, работающей в рамках совместной деятельности.

1. Освобождение от НДС по подпункту 2 пункта 2 статьи 149 НК РФ распространяется только на медицинские услуги, которые организация или ИП оказывает самостоятельно. Услуги, реализованные в рамках договора простого товарищества, под освобождение не подпадают и облагаются НДС по ставке 20%.
2. Исчислять и уплачивать НДС по операциям товарищества обязан участник, ведущий общий учет (статья 174.1 НК РФ). Он выставляет счета-фактуры, ведет книгу продаж и сдает декларацию.
3. Участие в простом товариществе не указано в статье 284.1 НК РФ среди оснований, по которым медорганизация теряет право на ставку 0% по налогу на прибыль.

Итог для клиники: льготы сохраняются по собственной медицинской деятельности и перестают работать по услугам, оказанным через товарищество. Отсюда раздельный учет, отдельные счета-фактуры и разные разделы декларации по НДС для двух потоков операций.

Освобождение по статье 149 НК РФ не отменяется, работать в простом товариществе медклиникам не запрещено. Разъяснение лишь разграничивает две ситуации: услуга оказана от своего имени и услуга оказана в рамках совместной деятельности.

Осторожность не помешает: полный текст письма публикуется с задержкой, а формулировки ведомства иногда уточняются. Перед изменением учетной политики и договора сверьтесь с официальной публикацией документа и с действующими редакциями статей 149, 174.1 и 284.1 НК РФ.

Освобождение от НДС медицинских услуг по статье 149 НК РФ: когда льгота работает

Подпункт 2 пункта 2 статьи 149 НК РФ освобождает от НДС медицинские товары, перечисленные в перечне Правительства РФ, и медицинские услуги. Для услуг отдельный перечень не нужен: льгота не распространяется на косметические, ветеринарные и санитарно-эпидемиологические услуги, все остальные медицинские услуги освобождены.

Условия применения: у организации или ИП есть лицензия на медицинскую деятельность, услуга оказана в рамках этой деятельности и ее оказал сам налогоплательщик.

Разъяснения по статье 149 в других сферах строятся по такому же принципу: льгота привязана к конкретной услуге и к статусу исполнителя. Пример разбора - материал про освобождение от НДС для услуг по обращению с ТКО: позиция Минфина в 2026 году, где право на льготу зависит от статуса регионального оператора, а не от вида отходов.

Самостоятельные медуслуги и услуги в рамках товарищества: в чем разница

В договоре простого товарищества пропишите, кто и какие услуги оказывает, кто ведет общий учет и как распределяются расходы. Если клиника принимает пациентов по своей лицензии, а товарищество только распределяет доходы, спор о природе операций почти неизбежен.

При сочетании облагаемых и необлагаемых операций включайте раздельный учет НДС: этого требует пункт 4 статьи 170 НК РФ.

Кто платит НДС в простом товариществе: статья 174.1 НК РФ

Статья 174.1 НК РФ переносит обязанности налогоплательщика на участника, ведущего общий учет операций. Этот участник:

• исчисляет НДС при реализации товаров, работ и услуг в рамках совместной деятельности;
• выставляет счета-фактуры покупателям от своего имени;
• ведет книгу продаж и книгу покупок по операциям товарищества;
• применяет вычеты по этим операциям при наличии счетов-фактур поставщиков (пункт 3 статьи 174.1 НК РФ);
• отражает операции в декларации и перечисляет налог в бюджет.

Обязанность возникает независимо от режима налогообложения, который применяет участник, ведущий общие дела. Если общий учет ведет медклиника на УСН, операции товарищества она отражает в декларации по НДС, а по собственной деятельности продолжает работать в рамках своего режима.

Ответственность за налог ложится на того же участника: недоимку, пени и штраф по операциям товарищества взыщут с него, а не с остальных товарищей. Внутренние расчеты (компенсация налога, распределение прибыли) регулируются договором.

Как отразить НДС в 1С, если общий учет ведет участник товарищества

• Проверьте, что договор с видом «Простое товарищество» создан и указан во всех документах реализации и поступления, относящихся к совместной деятельности.
• Расчеты с товарищами ведите на счете 76.09, а операции по совместной деятельности отделяйте от собственной медицинской деятельности.
• Реализацию в рамках товарищества оформляйте документом реализации с НДС 20%, собственные медуслуги - с признаком «НДС не облагается».
• Убедитесь, что счета-фактуры по операциям товарищества попадают в книгу продаж участника, ведущего общий учет, а не распределяются между товарищами.
• Проверьте декларацию: необлагаемые медуслуги должны попасть в раздел 7, операции товарищества - в разделы 3 и 9.

Счета-фактуры и расчетный метод в 2026 году стали отдельной зоной риска. Как изменились правила и что настроить в программе, разобрано в статье про новые правила НДС по длящимся договорам с 2026 года: настройка 1С и риски для покупателя.

Налог на прибыль: сохраняется ли ставка 0% при участии в простом товариществе

Статья 284.1 НК РФ дает медицинским организациям право на ставку 0% по налогу на прибыль. Перечень оснований для утраты этого права закрытый, и участия в договоре простого товарищества в нем нет. Сам факт совместной деятельности льготы не лишает.

Уточнение по кругу лиц: ставка 0% по статье 284.1 НК РФ доступна только организациям. Индивидуальный предприниматель на общей системе платит НДФЛ и применить эту льготу не может, хотя освобождение от НДС по медицинским услугам ему доступно на тех же условиях, что и клинике.

Прибыль от совместной деятельности считается отдельно. Налоговую базу по ней определяет участник, ведущий общий учет, и распределяет ее между товарищами пропорционально долям (статья 278 НК РФ). Убытки между участниками не распределяются. Свою долю распределенной прибыли участник учитывает в составе внереализационных доходов.

Условия применения ставки 0% по статье 284.1 НК РФ: чек-лист для медклиники

• Есть лицензия на медицинскую деятельность.
• Доходы от медицинской деятельности, включенной в перечень Правительства РФ, составляют не менее 90% общей суммы доходов.
• В штате непрерывно в течение налогового периода числится не менее 50% медицинских работников с сертификатом специалиста от общей численности работников.
• Организация не совершает операций с векселями и финансовыми инструментами срочных сделок.

Практический риск связан с условием о доле доходов. Распределенная прибыль товарищества добавляется к общей сумме доходов и размывает долю медицинской деятельности.

Числовой пример. Доходы от медуслуг 46 млн руб., прочие доходы 1 млн руб., распределенная прибыль товарищества 6 млн руб. Доля меддеятельности: 46 / 53 = 86,8%, то есть ниже 90%, и право на ставку 0% за год теряется. Без прибыли товарищества доля составила бы 46 / 47 = 97,9%, и льгота сохранялась.

Уточните в актуальной редакции статьи, к какой части налоговой базы применяется ставка 0% при наличии иных доходов, и закрепите расчет доли в учетной политике.

Настройки в 1С для медклиники в простом товариществе: пошаговый разбор

1. Включите нужный функционал в разделе «Главное» - «Функциональность». Состав флагов зависит от версии 1С: Бухгалтерия, поэтому проверьте наличие возможности вести учет по договорам простого товарищества и раздельный учет НДС.
2. Задайте учетную политику: «Главное» - «Учетная политика». На закладке НДС установите ведение раздельного учета по операциям реализации и выберите метод распределения косвенных расходов.
3. Настройте способы учета НДС: «Главное» - «Настройки» - «Способы учета НДС». Значения для счета 19: «Принимается к вычету», «Учитывается в стоимости», «Распределяется».
4. Создайте договор с видом «Простое товарищество» и указывайте его в документах поступления и реализации, относящихся к совместной деятельности.
5. Разделите потоки операций: собственная медицинская деятельность - реализация с признаком «НДС не облагается», услуги в рамках товарищества - реализация с НДС 20% и записью в книге продаж.
6. Выполните закрытие месяца, включая регламентные операции по распределению НДС и формированию книги продаж. Проверьте, что входной налог по общехозяйственным расходам распределен, а не списан целиком в вычет.
7. Сверьте декларацию: сумма необлагаемых медуслуг в разделе 7, операции товарищества в разделе 3, счета-фактуры в разделе 9.

Тестируйте настройки на копии базы. Ошибка в договоре или в способе учета НДС на счете 19 дает неверную книгу покупок и лишние вопросы при камеральной проверке.

Раздельный учет НДС в 1С: как избежать ошибок

Правило из пункта 4 статьи 170 НК РФ: если клиника одновременно проводит облагаемые и необлагаемые операции, входной НДС по общим расходам нужно распределять. Порядок закрепляйте в учетной политике и повторяйте его в настройках программы.

Пример. За квартал собственная медицинская деятельность дала 8 млн руб. выручки без НДС, услуги в рамках товарищества - 2 млн руб. с НДС. Доля необлагаемых операций 80%. Входной НДС по общехозяйственным расходам 100 000 руб. распределяется так: 80 000 руб. включаются в стоимость расходов, 20 000 руб. принимаются к вычету. Проводки: Дт 26 (или 91.02) Кт 19 на 80 000 руб. и Дт 68 Кт 19 на 20 000 руб.

Дорогая ошибка - принять весь входной НДС к вычету, не разделив его: при проверке снимут вычет по необлагаемой части и добавят пени. Обратная ошибка тоже встречается: включить в стоимость НДС по расходам, относящимся только к операциям товарищества, и потерять законный вычет.

Нюанс с восстановленным налогом: суммы, восстановленные по необлагаемым операциям, в расходы по налогу на прибыль не включают. Разбор похожей логики - в статье про то, почему восстановленный НДС нельзя учесть в расходах по прибыли.

Отражение операций по налогу на прибыль с учетом ставки 0%

В 1С ставка налога на прибыль задается в учетной политике («Главное» - «Учетная политика», раздел по налогу на прибыль) или в настройках налогов и отчетов, в зависимости от версии программы. Для медицинской деятельности укажите ставку 0%, если условия статьи 284.1 НК РФ выполнены.

Доходы и расходы по совместной деятельности ведите обособленно: тогда база по товариществу и база по льготируемой деятельности не смешаются. Распределенную прибыль отражайте в составе внереализационных доходов на дату, когда участник, ведущий общий учет, распределил ее.

Проверка перед сдачей отчетности: доля доходов от медицинской деятельности не менее 90%, численность медработников с сертификатом специалиста не менее 50%, отсутствие операций с векселями и финансовыми инструментами срочных сделок. Обоснование ставки 0% держите под рукой: расчет доли и штатную справку запрашивают при проверке.

Риски и типичные ошибки при применении льгот в простом товариществе

• Освобождение от НДС применено к услугам товарищества. Итог: недоимка, пени и штраф 20% от неуплаченной суммы по статье 122 НК РФ, при умысле - 40%.
• Раздельный учет не ведется. Итог: снимают вычет по необлагаемой части расходов, доначисляют налог.
• Неверно определен участник, ведущий общий учет. Итог: счета-фактуры выставлены не тем лицом, покупатели теряют вычет, а декларацию по операциям товарищества не сдает никто.
• Декларация заполнена без разделения потоков. Итог: необлагаемые медуслуги не попадают в раздел 7, операции товарищества теряются в разделе 3, возникают расхождения с книгой продаж.
• Условия статьи 284.1 НК РФ проверены без учета распределенной прибыли. Итог: доля меддеятельности ниже 90%, право на ставку 0% утрачено, налог пересчитывают по общей ставке.

Отдельная зона риска - договор. Если в нем не указано, кто оказывает услуги, кто ведет общий учет и как распределяются расходы, спор с налоговой почти обеспечен. Пропишите предмет договора, перечень услуг, порядок расчетов и ответственного за НДС.

Проверяйте и статус участников: ИП в простом товариществе теряет освобождение от НДС по услугам, оказанным через товарищество, ровно так же, как клиника. Разница в налоге на прибыль: ставка 0% по статье 284.1 НК РФ ИП недоступна.

Что делать после письма Минфина: практические шаги для бухгалтера

1. Проверьте договор простого товарищества: есть ли в нем распределение обязанностей по НДС и указание на участника, ведущего общий учет.
2. Оцените объем операций: какие услуги клиника оказывает от своего имени, какие - в рамках товарищества.
3. Убедитесь, что раздельный учет фактически ведется, а не только заявлен в учетной политике.
4. Проверьте настройки 1С: договор, счет 76.09, способы учета НДС, распределение при закрытии месяца.
5. Пересчитайте долю доходов от медицинской деятельности с учетом распределенной прибыли товарищества.
6. Внесите изменения в учетную политику на следующий год и зафиксируйте методику распределения расходов.
7. Отслеживайте уточнения Минфина и ФНС по этой теме: письмо отражает позицию ведомства, но не заменяет нормы НК РФ.

Письмо не относится к нормативным актам и новых обязанностей не создает. Опираться на него можно: письменные разъяснения защищают от пеней (пункт 8 статьи 75 НК РФ), а выполнение разъяснения снимает вину в неуплате налога (подпункт 3 пункта 1 статьи 111 НК РФ). При этом учет безопаснее строить на нормах НК РФ, а письмо использовать как дополнительный аргумент.

Частые вопросы по льготам в простом товариществе

Может ли ИП применить освобождение от НДС, если работает через простое товарищество?
Только по услугам, которые он оказывает самостоятельно. Услуги, реализованные в рамках совместной деятельности, освобождения не получают, НДС по ним исчисляет участник, ведущий общий учет.

Нужно ли восстанавливать НДС при входе в простое товарищество?
Зависит от дальнейшего использования имущества. Если товары или основные средства будут задействованы в облагаемых операциях товарищества, восстанавливать налог не требуется; для необлагаемых операций восстановление нужно. Решение принимайте по каждой позиции отдельно и фиксируйте вывод в учетной политике.

Как в 1С перейти на раздельный учет?
Включите раздельный учет НДС в учетной политике, настройте способы учета НДС и проверьте закрытие месяца на копии базы: распределение входного налога должно формироваться автоматически.

Распространяется ли письмо на прошлые периоды?
Письмо носит разъяснительный характер. Для оценки рисков прошлых периодов его применяют с даты публикации, а по уже сданным декларациям смотрят на редакции статей 149, 174.1 и 284.1 НК РФ, действовавшие в соответствующем периоде.

Сохраняется ли ставка 0% по налогу на прибыль, если часть услуг оказана через товарищество?
Само участие в товариществе права на ставку 0% не лишает. Проверьте остальные условия статьи 284.1 НК РФ, включая долю доходов от медицинской деятельности с учетом распределенной прибыли.